近几年来，兖州矿业（集团）有限责任公司及其下属厂矿对水污染、烟尘排放、固体废弃物和噪声污染等多个方面进行综合治理，依靠科技进步加快治理步伐，取得了明显的效果。
矸石治理
1)煤矿矸石山污染监测方法研究
兖州矿业（集团）公司环保中心在开展矸石山对周围环境空气、地表水及地下水造成污染现状研究的基础上，完成了对煤矸石及其渗透液、其附近地下水的采样、制样、样品保存和监测方法的制定。兖州矿区目前共有8个生产矿井、12座矸石山，矸石总量1.2mm3。这些矸石山既占用了大量耕地，又对周围的环境空气、地表水与地下水造成了污染，破坏了矿区的生态环境。
煤矸石污染监测分为三部分：
① 煤矸石。份样量的大小取决于矸石的粒度上限。粒度越大，均匀性越差，份样量就越多。煤矸石的粒径大小差别较大，要照顾到不同的类型和粒度。锥形矸石山按分层采样法在顶部、腰部和底部距地面1m以上分别采样。平面形矸石山按其面积均匀划分若干区域分别采样。在制样过程中应防止样品产生任何化学变化和污染。若可能对样品质量产生显著影响，则应尽量保持原态。对煤矸石浸出液分别进行腐蚀性鉴别，其中浸出毒性鉴别包括汞、铅、镉、铜、锌、砷、氟化物与硫化物。
② 煤矸石渗滤液。采样点设在排放口。为了解对污水的处理效果，也可在进水口和出水口同时采样。污水采样记录表中应有污染源名称、监测目的、监测项目、采样点位、采样时间、样品编号、污水性质、污水流量、采样人姓名及其它有关事项。凡需现场监测的项目应进行现场监测，需要固定的水样必须现场固定。测试分析时选择一般工业固体废物的特征组分作为控制项目，包括ph值等。
③ 矸石山地下水。地下水监测常以浅层为主，应尽可能利用各水文地质部门的原有水井。污染监控井沿地下水流向设在贮存场下游。当地质和水文地质资料表明含水层埋藏较深，经论证认定地下水不会被污染时可不设监控井。每年按枯水期和丰水期分别采样，对有异常情况的监测井适当增加采样次数。
2）地面排矸系统的技术改造
兖州矿业（集团）公司南屯煤矿在山东科技大学的支持下，研究设计出一种新型的“矿内胶带运输矸石排放系统”，使该矿的矸石车辆不用再出矿井即可通过汽车直接运往矿外的塌陷区排放，而且还便于对塌陷区进行综合治理。新研制的“矿内胶带运输矸石排放系统”工艺流程如下：副井、混合井的升井矸石车→左侧式3t翻车机→k-4型往复式给煤机→胶带输送机→拣杂→储矸仓→汽车→塌陷区。
与过去的矸石山排放矸石系统相比，新的地面排矸系统具有以下优点：彻底消除矸石山因堆积煤矸石太多而出现自燃、塌方和环境污染现象意见因灭火而造成的大量水资源浪费，避免了因易出现山体滑坡、塌方而对施工人员和周围群众造成人身伤害；矸石回填塌陷区，使塌陷区得到了有效的治理，大部分可以恢复为良田耕种作物，弥补了因矸石山堆放矸石太多而占用大量耕地的损失；自从该新系统投入使用以来，省下了矸石山2m双筒提升绞车与电气控制系统的维修费用、每两个月更换一次2000mφ21.5mm钢丝绳的费用，为矿井节约了大量的资金，同时还取消了原矸石山绞车司机9人、机电设备专职维修工6人，实现了减人提效；由于在新排矸系统的皮带走廊中安设6个拣杂口，使得混在矸石中的大量块煤、废铁、旧锚杆、旧钢丝绳及其它可回收物资能得到全面回收，经济效益非常显著；在新的排矸系统中，矸石车辆上井后，电机车拉运距离仅为 150m就可进行翻罐，运输距离的大大缩短使得矿车周转更加快捷方便，扭转了矿车使用紧张的被动局面。